L’Université Libre des Pays des Grands Lacs est une institution d’utilité publique issue de la transformation, en mars 1990, de l’Institut Supérieur de Théologie Protestante (ISTP) de Goma dont la création remonte à 1985.
L’arrêté du Ministre de l’Enseignement Supérieur et Universitaire N°ESU/ CABMIN/ 0188/91 du 16/08/91 lui accorda l’autorisation d’ouverture, tandis que celui portant N° ESURS/ CABMIN/0108/92 du 02 mai 1992 reconnaissait les diplômes délivrés par l’ULPGL. Ce dernier arrêté fut modifié et complété par l’arrêté ministériel N° ESURS/ CABMIN/A5/0022/96 du 31 janvier 1996 portant agrément de l’ULPGL, le Décret N° 0016 du 27 mai 1996 accordant la personnalité civile à l’ULPGL et enfin, le Décret présidentiel N° 06/0106 du 12 juin 2006 portant agrément de quelques universités privées.
Aux facultés de Théologie et de Droit se sont rapidement ajoutées les Sciences économiques et de gestion, les Sciences et technologies appliquées, la Santé et développement communautaires ainsi que la Psychologie et Sciences de l’éducation.
L’ULPGL est une institution d’obédience chrétienne qui veut demeurer et évoluer dans une sphère de liberté. Elle reste, de par son nom et sa nature, « apolitique » et garantit la liberté académique à tous. Elle reçoit des étudiants et des chercheurs sans distinction d'âge, de sexe, de race, de religion, de nationalité, de classe sociale, d’opinion philosophique ou politique.
L’ULPGL est une université enracinée dans son environnement par ses contacts divers avec la société ainsi que par son impact sur le milieu où elle est implantée.
L’Université Libre des Pays des Grands Lacs poursuit, entre autres les objectifs ci-après :

• L’enseignement universitaire, la recherche scientifique et tout autre action pouvant directement et indirectement favoriser l’enseignement et la recherche;
• Participer au développement régional en partant des initiatives de la base et des activités propres aux groupes sociaux par une nouvelle approche de la recherche scientifique et de l’enseignement correspondant aux besoins et aux aspirations de la population en respectant les convictions et les ressources de la région ;
• Assurer une formation intellectuelle et morale conforme à l’éthique chrétienne ;
• Pallier à la carence des cadres compétents dans différents domaines de la vie des populations de la Région des grands lacs africains;
• Pallier au manque de planification de la formation universitaire entraînant le sous-emploi des cadres universitaires.
  Le pari est grand pour cette université qui cherche à assurer à l’apprenant une formation complète afin de le rendre plus utile à sa société.